执行委员会是现代服务业智库的日常运行管理机构。主要职责是担当课题分析、人员组织、经费预算、过程管理、课题验收、档案管理等项目管理事务，负责科研项目的联络、学科资源的整合、学术成果的撰写和推广等。执行委员会成员一般由具备一定管理经验和管理能力的中青年学者和院外兼职研究专家担任。根据具体的职责分工，执行委员会下设五个研究中心和一个现代服务业创新创业平台。